Tahfidz Qur’an merupakan program utama di Rumah Yatim dan Tahfidz Qur’an Madani  dengan tujuan untuk mencetak generasi muda yang tidak hanya hafal al-Qur’an saja,  melainkan mampu memahami dan mengamalkan isi dari kandungan ayat suci al-Qur’an.  Program ini dibimbing oleh muhafidz dan muhafidzah yang profesional dan berpengalaman  sehingga para santri akan dibina secara intensif dan persisten dalam proses menghafal 30 Juz sampai mutqin.